Государственное учреждение «Марийский республиканский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды (сокращенное наименование – ГУ «Марийский ЦГМС») является организацией Федеральной службы по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды (сокращенное наименование – Росгидромет), созданной 22.09.1998 г Указом Президента Российской Федерации.
ГУ «Марийский ЦГМС» выполняет специальные (исполнительные и контрольные) функции в области гидрометеорологии и смежных с ней областях и осуществляет производство наблюдений за гидрометеорологическими процессами, загрязнением окружающей природной среды, обеспечение органов государственной власти, отраслей экономики, оборонных и других организаций и населения информацией о фактическом и прогнозируемом состоянии окружающей природной среды, её загрязнении, в том числе экстренной информацией на территории Республики Марий Эл.
Общее руководство деятельностью ГУ «Марийский ЦГМС» осуществляется Росгидрометом, по вопросам, отнесенным к компетенции территориальных органов Росгидромета, осуществляет Верне-Волжское межрегиональное территориальное управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды (сокращенное наименование – Верхнее-Волжское УГМС).
В своей деятельности ГУ «Марийский ЦГМС» руководствуется Конституцией Российской Федерации, Федеральным Законом от 19 июля 1998 года № 113-ФЗ «О гидрометеорологической службе» (с изменениями  и дополнениями от 25 июля 2002г., 22 августа 2004г., 3 июня 2005г.), Федеральным Законом от 20 февраля 1995г. № 24-ФЗ «Об информации, информатизации и защите информации», постановлением Правительства Российской Федерации от 15 ноября 1997г. № 1425 «Об информационных услугах в области гидрометеорологии и мониторинга загрязнения окружающей природной среды», Федеральным Законом от 10.01.2002 г.
№ 7-ФЗ «Об охране окружающей среды», постановлением Правительства Российской Федерации от 30 декабря 2003г. № 794 «О единой государственной системе предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций», гражданским законодательством Российской Федерации, приказами и распоряжениями Росгидромета, организационно-распорядительными документами Верхне-Волжского УГМС, а также Уставом ГУ «Марийский ЦГМС».